Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
S1PR4O95977 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
S1PR4O95977 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
S1PR4O95977 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
S1PR4O95977 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms