Protein–RNA interactions for Protein: O95716

RAB3D, Ras-related protein Rab-3D, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3DO95716 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3DO95716 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3DO95716 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms