Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNTO95613 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNTO95613 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNTO95613 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNTO95613 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNTO95613 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNTO95613 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNTO95613 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCNTO95613 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PCNTO95613 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCNTO95613 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNTO95613 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNTO95613 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNTO95613 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCNTO95613 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCNTO95613 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCNTO95613 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCNTO95613 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCNTO95613 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCNTO95613 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PCNTO95613 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNTO95613 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNTO95613 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNTO95613 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNTO95613 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNTO95613 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNTO95613 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCNTO95613 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PCNTO95613 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCNTO95613 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNTO95613 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNTO95613 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNTO95613 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNTO95613 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNTO95613 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCNTO95613 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNTO95613 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNTO95613 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCNTO95613 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCNTO95613 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCNTO95613 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCNTO95613 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNTO95613 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNTO95613 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNTO95613 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNTO95613 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCNTO95613 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNTO95613 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNTO95613 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNTO95613 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNTO95613 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCNTO95613 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNTO95613 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNTO95613 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNTO95613 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNTO95613 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNTO95613 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCNTO95613 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCNTO95613 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCNTO95613 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCNTO95613 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PCNTO95613 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCNTO95613 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCNTO95613 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCNTO95613 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCNTO95613 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNTO95613 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNTO95613 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNTO95613 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNTO95613 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNTO95613 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCNTO95613 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCNTO95613 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCNTO95613 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms