Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCTN3O75935 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN3O75935 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN3O75935 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms