Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE3O75131 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE3O75131 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms