Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3LO60238 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BNIP3LO60238 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3LO60238 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms