Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC8O43402 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC8O43402 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC8O43402 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC8O43402 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC8O43402 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC8O43402 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC8O43402 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC8O43402 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMC8O43402 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC8O43402 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC8O43402 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC8O43402 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC8O43402 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC8O43402 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC8O43402 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC8O43402 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC8O43402 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC8O43402 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC8O43402 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC8O43402 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC8O43402 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC8O43402 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC8O43402 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC8O43402 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC8O43402 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC8O43402 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC8O43402 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC8O43402 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC8O43402 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC8O43402 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC8O43402 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC8O43402 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC8O43402 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC8O43402 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC8O43402 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC8O43402 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms