Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CITO14578 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CITO14578 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CITO14578 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CITO14578 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CITO14578 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CITO14578 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CITO14578 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CITO14578 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CITO14578 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CITO14578 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CITO14578 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CITO14578 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CITO14578 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CITO14578 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CITO14578 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CITO14578 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CITO14578 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CITO14578 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CITO14578 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CITO14578 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CITO14578 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CITO14578 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CITO14578 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CITO14578 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CITO14578 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CITO14578 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CITO14578 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CITO14578 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CITO14578 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CITO14578 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CITO14578 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CITO14578 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CITO14578 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CITO14578 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CITO14578 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CITO14578 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CITO14578 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CITO14578 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CITO14578 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CITO14578 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CITO14578 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CITO14578 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CITO14578 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CITO14578 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CITO14578 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CITO14578 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CITO14578 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CITO14578 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CITO14578 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CITO14578 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CITO14578 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CITO14578 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CITO14578 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CITO14578 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CITO14578 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CITO14578 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CITO14578 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CITO14578 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CITO14578 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CITO14578 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CITO14578 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CITO14578 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CITO14578 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CITO14578 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CITO14578 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CITO14578 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CITO14578 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms