Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAD1O00515 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAD1O00515 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAD1O00515 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LAD1O00515 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAD1O00515 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAD1O00515 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAD1O00515 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAD1O00515 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAD1O00515 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAD1O00515 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAD1O00515 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAD1O00515 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LAD1O00515 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAD1O00515 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAD1O00515 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAD1O00515 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAD1O00515 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAD1O00515 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAD1O00515 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAD1O00515 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAD1O00515 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAD1O00515 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAD1O00515 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAD1O00515 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAD1O00515 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAD1O00515 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAD1O00515 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAD1O00515 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAD1O00515 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAD1O00515 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAD1O00515 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAD1O00515 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAD1O00515 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAD1O00515 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LAD1O00515 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAD1O00515 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAD1O00515 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAD1O00515 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAD1O00515 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAD1O00515 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAD1O00515 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LAD1O00515 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAD1O00515 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAD1O00515 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LAD1O00515 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAD1O00515 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LAD1O00515 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LAD1O00515 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAD1O00515 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAD1O00515 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAD1O00515 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAD1O00515 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAD1O00515 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAD1O00515 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAD1O00515 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAD1O00515 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAD1O00515 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms