Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO7DNF2Z398 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO7DNF2Z398 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO7DNF2Z398 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms