Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
E9PCH4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
E9PCH4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
E9PCH4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
E9PCH4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
E9PCH4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
E9PCH4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
E9PCH4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
E9PCH4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
E9PCH4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
E9PCH4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
E9PCH4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
E9PCH4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
E9PCH4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
E9PCH4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
E9PCH4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
E9PCH4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
E9PCH4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
E9PCH4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
E9PCH4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
E9PCH4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
E9PCH4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
E9PCH4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
E9PCH4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
E9PCH4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
E9PCH4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
E9PCH4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
E9PCH4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
E9PCH4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
E9PCH4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
E9PCH4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
E9PCH4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
E9PCH4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
E9PCH4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
E9PCH4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
E9PCH4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
E9PCH4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
E9PCH4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
E9PCH4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
E9PCH4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
E9PCH4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
E9PCH4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
E9PCH4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
E9PCH4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
E9PCH4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
E9PCH4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
E9PCH4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
E9PCH4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
E9PCH4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
E9PCH4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
E9PCH4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
E9PCH4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
E9PCH4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
E9PCH4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
E9PCH4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
E9PCH4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
E9PCH4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
E9PCH4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
E9PCH4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
E9PCH4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
E9PCH4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
E9PCH4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
E9PCH4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
E9PCH4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
E9PCH4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
E9PCH4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
E9PCH4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
E9PCH4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
E9PCH4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
E9PCH4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
E9PCH4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
E9PCH4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
E9PCH4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
E9PCH4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
E9PCH4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
E9PCH4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
E9PCH4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
E9PCH4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
E9PCH4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
E9PCH4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
E9PCH4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
E9PCH4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
E9PCH4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
E9PCH4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
E9PCH4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
E9PCH4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms