Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR3A8MPY1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRR3A8MPY1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR3A8MPY1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms