Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0J9YVX5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YVX5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms