Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AUP1Q9Y679 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AUP1Q9Y679 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AUP1Q9Y679 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms