Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C5Q9Y5Q8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF3C5Q9Y5Q8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C5Q9Y5Q8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms