Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms