Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX13Q9UN79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX13Q9UN79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX13Q9UN79 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX13Q9UN79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms