Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A4Q9UKG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC13A4Q9UKG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms