Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APPL1Q9UKG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL1Q9UKG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL1Q9UKG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms