Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFF4Q9UHB7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFF4Q9UHB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFF4Q9UHB7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms