Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS29Q9UBQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS29Q9UBQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS29Q9UBQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms