Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR35Q9P2L0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR35Q9P2L0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms