Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
USP35Q9P2H5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP35Q9P2H5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP35Q9P2H5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP35Q9P2H5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP35Q9P2H5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
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