Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD7Q9P2D1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD7Q9P2D1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD7Q9P2D1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms