Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GDAP2Q9NXN4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDAP2Q9NXN4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms