Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO8Q9NRD0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO8Q9NRD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO8Q9NRD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms