Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBN1Q9NPG3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBN1Q9NPG3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBN1Q9NPG3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBN1Q9NPG3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms