Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZCCHC17Q9NP64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZCCHC17Q9NP64 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC17Q9NP64 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms