Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB6Q9NP58 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB6Q9NP58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB6Q9NP58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms