Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRHQ9HD43 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRHQ9HD43 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRHQ9HD43 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRHQ9HD43 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRHQ9HD43 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRHQ9HD43 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRHQ9HD43 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRHQ9HD43 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRHQ9HD43 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRHQ9HD43 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRHQ9HD43 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms