Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAMQ9HCL2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPAMQ9HCL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPAMQ9HCL2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms