Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RPAP3Q9H6T3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPAP3Q9H6T3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPAP3Q9H6T3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms