Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG9Q9H0W8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG9Q9H0W8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG9Q9H0W8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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