Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COMMD5Q9GZQ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COMMD5Q9GZQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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