Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BARHL1Q9BZE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BARHL1Q9BZE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms