Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMCQ9BYG8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMCQ9BYG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms