Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF1Q9BXJ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1QTNF1Q9BXJ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF1Q9BXJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms