Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC2P3Q9BVR0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC2P3Q9BVR0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC2P3Q9BVR0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms