Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YME1L1Q96TA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YME1L1Q96TA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
YME1L1Q96TA2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YME1L1Q96TA2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms