Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC2Q96PR1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC2Q96PR1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms