Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIPOR3Q96MK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIPOR3Q96MK2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPOR3Q96MK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPOR3Q96MK2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms