Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf30Q96M34 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf30Q96M34 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf30Q96M34 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf30Q96M34 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf30Q96M34 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf30Q96M34 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf30Q96M34 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf30Q96M34 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf30Q96M34 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C3orf30Q96M34 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms