Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRC1Q96M27 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRC1Q96M27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRC1Q96M27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms