Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN2Q96LZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RMDN2Q96LZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN2Q96LZ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms