Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf42Q96LP6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C12orf42Q96LP6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C12orf42Q96LP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms