Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDLIM2Q96JY6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDLIM2Q96JY6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms