Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC34Q96HJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC34Q96HJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC34Q96HJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms