Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRELD1Q96HD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRELD1Q96HD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms