Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM12Q96EX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms