Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms